MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicycliphilus denitrificans BC plasmid pALIDE02

Total Repeats: 1690

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014911	CGA	2	6	70010	70015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765140
1502	NC_014911	GCA	2	6	70060	70065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765140
1503	NC_014911	GCC	2	6	70120	70125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765140
1504	NC_014911	GGC	2	6	70149	70154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765140
1505	NC_014911	ATC	2	6	70155	70160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319765140
1506	NC_014911	GCC	2	6	70173	70178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765140
1507	NC_014911	GCA	2	6	70199	70204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765140
1508	NC_014911	GCA	2	6	70211	70216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765140
1509	NC_014911	T	7	7	70298	70304	0 %	100 %	0 %	0 %	319765141
1510	NC_014911	GCA	2	6	70312	70317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765141
1511	NC_014911	GCT	2	6	70323	70328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765141
1512	NC_014911	TTG	2	6	70337	70342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319765141
1513	NC_014911	AAC	2	6	70391	70396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319765141
1514	NC_014911	CCG	2	6	70443	70448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765141
1515	NC_014911	TGA	2	6	70527	70532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319765141
1516	NC_014911	GT	3	6	70539	70544	0 %	50 %	50 %	0 %	319765141
1517	NC_014911	GTG	2	6	70612	70617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319765141
1518	NC_014911	CGC	2	6	70704	70709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765141
1519	NC_014911	CGG	2	6	70737	70742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765141
1520	NC_014911	GCCG	2	8	70783	70790	0 %	0 %	50 %	50 %	319765141
1521	NC_014911	CGC	2	6	70864	70869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765141
1522	NC_014911	GC	3	6	70928	70933	0 %	0 %	50 %	50 %	319765141
1523	NC_014911	GGT	2	6	70948	70953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319765141
1524	NC_014911	CTGG	2	8	70984	70991	0 %	25 %	50 %	25 %	319765141
1525	NC_014911	GAA	2	6	71071	71076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319765141
1526	NC_014911	TGC	2	6	71082	71087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765141
1527	NC_014911	CCA	2	6	71145	71150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319765141
1528	NC_014911	CGA	2	6	71152	71157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765141
1529	NC_014911	CGG	2	6	71245	71250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765141
1530	NC_014911	GAC	2	6	71326	71331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765141
1531	NC_014911	GTC	2	6	71341	71346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765141
1532	NC_014911	CTG	3	9	71440	71448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765141
1533	NC_014911	CAG	2	6	71452	71457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765141
1534	NC_014911	TGC	2	6	71460	71465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765141
1535	NC_014911	CCG	2	6	71495	71500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765141
1536	NC_014911	CA	3	6	71563	71568	50 %	0 %	0 %	50 %	319765141
1537	NC_014911	GCC	2	6	71587	71592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765141
1538	NC_014911	GCC	3	9	71648	71656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765141
1539	NC_014911	CGC	2	6	71667	71672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765141
1540	NC_014911	ATG	2	6	71678	71683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319765141
1541	NC_014911	GCG	2	6	71774	71779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765141
1542	NC_014911	GGC	2	6	71782	71787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765141
1543	NC_014911	CAG	2	6	71788	71793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765141
1544	NC_014911	CGG	2	6	71808	71813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765141
1545	NC_014911	GC	3	6	71829	71834	0 %	0 %	50 %	50 %	319765141
1546	NC_014911	T	7	7	71949	71955	0 %	100 %	0 %	0 %	319765141
1547	NC_014911	GCA	2	6	71976	71981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765142
1548	NC_014911	GCAG	2	8	72043	72050	25 %	0 %	50 %	25 %	319765142
1549	NC_014911	ATG	2	6	72154	72159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319765142
1550	NC_014911	GCA	2	6	72167	72172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765142
1551	NC_014911	TGA	2	6	72206	72211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319765143
1552	NC_014911	CAT	2	6	72265	72270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319765143
1553	NC_014911	ACC	2	6	72279	72284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319765143
1554	NC_014911	CG	3	6	72289	72294	0 %	0 %	50 %	50 %	319765143
1555	NC_014911	CTT	2	6	72344	72349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319765143
1556	NC_014911	GGC	2	6	72410	72415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765143
1557	NC_014911	CAA	2	6	72427	72432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319765143
1558	NC_014911	AGC	2	6	72456	72461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765143
1559	NC_014911	ACG	2	6	72501	72506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765144
1560	NC_014911	GGC	2	6	72611	72616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765144
1561	NC_014911	GCC	2	6	72634	72639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765144
1562	NC_014911	GAA	2	6	72644	72649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319765144
1563	NC_014911	CCA	2	6	72655	72660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319765144
1564	NC_014911	GCA	2	6	72761	72766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765144
1565	NC_014911	CGAGG	2	10	72770	72779	20 %	0 %	60 %	20 %	319765144
1566	NC_014911	GGC	2	6	72782	72787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765144
1567	NC_014911	GC	3	6	72805	72810	0 %	0 %	50 %	50 %	319765144
1568	NC_014911	GCA	2	6	73028	73033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765145
1569	NC_014911	CGC	2	6	73036	73041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765145
1570	NC_014911	GCT	2	6	73122	73127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765145
1571	NC_014911	GGA	2	6	73134	73139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319765145
1572	NC_014911	CAG	2	6	73161	73166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765145
1573	NC_014911	GC	3	6	73216	73221	0 %	0 %	50 %	50 %	319765145
1574	NC_014911	GAA	2	6	73308	73313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319765145
1575	NC_014911	CGGT	2	8	73506	73513	0 %	25 %	50 %	25 %	319765146
1576	NC_014911	GCC	2	6	73518	73523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765146
1577	NC_014911	CCCAGC	2	12	73600	73611	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	319765146
1578	NC_014911	GGT	2	6	73709	73714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319765146
1579	NC_014911	GGC	2	6	73903	73908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765146
1580	NC_014911	GCC	2	6	73913	73918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765146
1581	NC_014911	GCCG	2	8	73946	73953	0 %	0 %	50 %	50 %	319765146
1582	NC_014911	GTG	2	6	74070	74075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319765147
1583	NC_014911	TGGT	2	8	74085	74092	0 %	50 %	50 %	0 %	319765147
1584	NC_014911	CGT	2	6	74146	74151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765147
1585	NC_014911	CG	3	6	74159	74164	0 %	0 %	50 %	50 %	319765147
1586	NC_014911	CGC	2	6	74197	74202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765147
1587	NC_014911	GC	3	6	74215	74220	0 %	0 %	50 %	50 %	319765147
1588	NC_014911	GCC	2	6	74256	74261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765147
1589	NC_014911	GT	3	6	74322	74327	0 %	50 %	50 %	0 %	319765147
1590	NC_014911	CAGC	2	8	74365	74372	25 %	0 %	25 %	50 %	319765147
1591	NC_014911	GGC	2	6	74401	74406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765147
1592	NC_014911	CAC	2	6	74486	74491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319765147
1593	NC_014911	GCG	2	6	74532	74537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765147
1594	NC_014911	G	6	6	74557	74562	0 %	0 %	100 %	0 %	319765147
1595	NC_014911	ACT	2	6	74724	74729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319765148
1596	NC_014911	GC	3	6	74738	74743	0 %	0 %	50 %	50 %	319765148
1597	NC_014911	GCG	2	6	74754	74759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765148
1598	NC_014911	GCA	2	6	74770	74775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765148
1599	NC_014911	GCG	2	6	74812	74817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765148
1600	NC_014911	CTG	2	6	74855	74860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765148
1601	NC_014911	CCGAG	2	10	74865	74874	20 %	0 %	40 %	40 %	319765148
1602	NC_014911	CTG	2	6	74876	74881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765148
1603	NC_014911	CG	3	6	74889	74894	0 %	0 %	50 %	50 %	319765148
1604	NC_014911	CGC	2	6	74914	74919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765148
1605	NC_014911	TGT	2	6	74940	74945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319765148
1606	NC_014911	TGC	2	6	75006	75011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765148
1607	NC_014911	GCT	2	6	75055	75060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765148
1608	NC_014911	GCC	2	6	75098	75103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765148
1609	NC_014911	TGC	2	6	75138	75143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765148
1610	NC_014911	GATG	2	8	75151	75158	25 %	25 %	50 %	0 %	319765148
1611	NC_014911	GGC	2	6	75159	75164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765148
1612	NC_014911	CTG	2	6	75179	75184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765148
1613	NC_014911	CG	4	8	75208	75215	0 %	0 %	50 %	50 %	319765148
1614	NC_014911	GGC	2	6	75268	75273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765148
1615	NC_014911	CG	4	8	75290	75297	0 %	0 %	50 %	50 %	319765148
1616	NC_014911	CGC	3	9	75301	75309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765148
1617	NC_014911	CGGTGG	2	12	75399	75410	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	319765148
1618	NC_014911	GC	4	8	75449	75456	0 %	0 %	50 %	50 %	319765148
1619	NC_014911	CG	3	6	75483	75488	0 %	0 %	50 %	50 %	319765148
1620	NC_014911	CTGG	2	8	75490	75497	0 %	25 %	50 %	25 %	319765148
1621	NC_014911	GCA	2	6	75499	75504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765148
1622	NC_014911	TGT	2	6	75724	75729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319765149
1623	NC_014911	GAAGC	2	10	75739	75748	40 %	0 %	40 %	20 %	319765149
1624	NC_014911	CGC	2	6	75778	75783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765149
1625	NC_014911	CG	3	6	75789	75794	0 %	0 %	50 %	50 %	319765149
1626	NC_014911	TGC	2	6	75807	75812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765149
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.